Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CNGB1Q14028 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNGB1Q14028 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNGB1Q14028 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNGB1Q14028 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNGB1Q14028 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNGB1Q14028 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNGB1Q14028 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNGB1Q14028 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNGB1Q14028 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNGB1Q14028 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNGB1Q14028 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CNGB1Q14028 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNGB1Q14028 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNGB1Q14028 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNGB1Q14028 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNGB1Q14028 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNGB1Q14028 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNGB1Q14028 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNGB1Q14028 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNGB1Q14028 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNGB1Q14028 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNGB1Q14028 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNGB1Q14028 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNGB1Q14028 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNGB1Q14028 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNGB1Q14028 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNGB1Q14028 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNGB1Q14028 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNGB1Q14028 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNGB1Q14028 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNGB1Q14028 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNGB1Q14028 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNGB1Q14028 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNGB1Q14028 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNGB1Q14028 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNGB1Q14028 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNGB1Q14028 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CNGB1Q14028 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNGB1Q14028 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNGB1Q14028 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNGB1Q14028 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNGB1Q14028 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNGB1Q14028 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNGB1Q14028 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNGB1Q14028 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNGB1Q14028 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNGB1Q14028 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNGB1Q14028 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNGB1Q14028 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNGB1Q14028 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNGB1Q14028 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNGB1Q14028 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNGB1Q14028 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNGB1Q14028 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNGB1Q14028 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNGB1Q14028 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNGB1Q14028 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNGB1Q14028 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNGB1Q14028 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNGB1Q14028 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNGB1Q14028 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNGB1Q14028 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CNGB1Q14028 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNGB1Q14028 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CNGB1Q14028 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CNGB1Q14028 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNGB1Q14028 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNGB1Q14028 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNGB1Q14028 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CNGB1Q14028 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNGB1Q14028 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNGB1Q14028 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNGB1Q14028 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNGB1Q14028 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNGB1Q14028 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNGB1Q14028 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNGB1Q14028 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNGB1Q14028 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNGB1Q14028 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CNGB1Q14028 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CNGB1Q14028 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CNGB1Q14028 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CNGB1Q14028 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CNGB1Q14028 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CNGB1Q14028 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CNGB1Q14028 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CNGB1Q14028 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CNGB1Q14028 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CNGB1Q14028 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CNGB1Q14028 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CNGB1Q14028 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CNGB1Q14028 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CNGB1Q14028 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CNGB1Q14028 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CNGB1Q14028 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CNGB1Q14028 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CNGB1Q14028 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CNGB1Q14028 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CNGB1Q14028 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
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