Protein–RNA interactions for Protein: Q14003

KCNC3, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 3, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC3Q14003 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KCNC3Q14003 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KCNC3Q14003 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KCNC3Q14003 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KCNC3Q14003 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KCNC3Q14003 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KCNC3Q14003 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KCNC3Q14003 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KCNC3Q14003 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
KCNC3Q14003 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
KCNC3Q14003 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KCNC3Q14003 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KCNC3Q14003 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
KCNC3Q14003 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
KCNC3Q14003 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KCNC3Q14003 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KCNC3Q14003 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KCNC3Q14003 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KCNC3Q14003 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KCNC3Q14003 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KCNC3Q14003 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
KCNC3Q14003 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
KCNC3Q14003 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
KCNC3Q14003 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
KCNC3Q14003 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
KCNC3Q14003 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
KCNC3Q14003 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
KCNC3Q14003 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KCNC3Q14003 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KCNC3Q14003 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KCNC3Q14003 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KCNC3Q14003 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KCNC3Q14003 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KCNC3Q14003 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KCNC3Q14003 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KCNC3Q14003 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KCNC3Q14003 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KCNC3Q14003 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KCNC3Q14003 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KCNC3Q14003 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KCNC3Q14003 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KCNC3Q14003 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KCNC3Q14003 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KCNC3Q14003 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KCNC3Q14003 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
KCNC3Q14003 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
KCNC3Q14003 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KCNC3Q14003 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KCNC3Q14003 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KCNC3Q14003 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KCNC3Q14003 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KCNC3Q14003 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KCNC3Q14003 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KCNC3Q14003 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KCNC3Q14003 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KCNC3Q14003 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KCNC3Q14003 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KCNC3Q14003 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KCNC3Q14003 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KCNC3Q14003 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
KCNC3Q14003 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KCNC3Q14003 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KCNC3Q14003 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
KCNC3Q14003 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KCNC3Q14003 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KCNC3Q14003 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KCNC3Q14003 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
KCNC3Q14003 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KCNC3Q14003 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KCNC3Q14003 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KCNC3Q14003 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KCNC3Q14003 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KCNC3Q14003 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KCNC3Q14003 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KCNC3Q14003 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
KCNC3Q14003 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
KCNC3Q14003 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KCNC3Q14003 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KCNC3Q14003 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KCNC3Q14003 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KCNC3Q14003 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCNC3Q14003 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCNC3Q14003 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCNC3Q14003 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCNC3Q14003 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
KCNC3Q14003 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCNC3Q14003 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCNC3Q14003 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCNC3Q14003 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCNC3Q14003 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCNC3Q14003 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCNC3Q14003 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCNC3Q14003 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCNC3Q14003 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCNC3Q14003 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
KCNC3Q14003 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCNC3Q14003 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
KCNC3Q14003 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCNC3Q14003 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCNC3Q14003 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
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