Protein–RNA interactions for Protein: Q13888

GTF2H2, General transcription factor IIH subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H2Q13888 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF2H2Q13888 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF2H2Q13888 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF2H2Q13888 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF2H2Q13888 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF2H2Q13888 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF2H2Q13888 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF2H2Q13888 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF2H2Q13888 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF2H2Q13888 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF2H2Q13888 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF2H2Q13888 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF2H2Q13888 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF2H2Q13888 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF2H2Q13888 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF2H2Q13888 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF2H2Q13888 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF2H2Q13888 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF2H2Q13888 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF2H2Q13888 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF2H2Q13888 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GTF2H2Q13888 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GTF2H2Q13888 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GTF2H2Q13888 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GTF2H2Q13888 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GTF2H2Q13888 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GTF2H2Q13888 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GTF2H2Q13888 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GTF2H2Q13888 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GTF2H2Q13888 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GTF2H2Q13888 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GTF2H2Q13888 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GTF2H2Q13888 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GTF2H2Q13888 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GTF2H2Q13888 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GTF2H2Q13888 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
GTF2H2Q13888 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GTF2H2Q13888 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GTF2H2Q13888 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
GTF2H2Q13888 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
GTF2H2Q13888 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GTF2H2Q13888 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GTF2H2Q13888 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
GTF2H2Q13888 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GTF2H2Q13888 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
GTF2H2Q13888 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GTF2H2Q13888 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GTF2H2Q13888 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GTF2H2Q13888 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF2H2Q13888 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF2H2Q13888 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF2H2Q13888 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF2H2Q13888 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF2H2Q13888 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF2H2Q13888 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF2H2Q13888 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF2H2Q13888 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF2H2Q13888 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF2H2Q13888 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF2H2Q13888 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF2H2Q13888 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF2H2Q13888 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF2H2Q13888 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF2H2Q13888 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF2H2Q13888 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF2H2Q13888 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF2H2Q13888 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF2H2Q13888 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF2H2Q13888 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF2H2Q13888 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF2H2Q13888 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF2H2Q13888 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF2H2Q13888 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF2H2Q13888 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF2H2Q13888 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF2H2Q13888 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF2H2Q13888 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF2H2Q13888 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF2H2Q13888 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF2H2Q13888 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF2H2Q13888 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF2H2Q13888 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF2H2Q13888 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF2H2Q13888 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF2H2Q13888 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF2H2Q13888 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF2H2Q13888 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF2H2Q13888 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF2H2Q13888 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GTF2H2Q13888 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF2H2Q13888 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF2H2Q13888 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF2H2Q13888 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF2H2Q13888 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF2H2Q13888 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF2H2Q13888 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF2H2Q13888 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF2H2Q13888 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF2H2Q13888 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GTF2H2Q13888 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms