Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FHL3Q13643 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms