Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HDAC1Q13547 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HDAC1Q13547 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HDAC1Q13547 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HDAC1Q13547 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HDAC1Q13547 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HDAC1Q13547 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HDAC1Q13547 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HDAC1Q13547 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HDAC1Q13547 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HDAC1Q13547 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HDAC1Q13547 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HDAC1Q13547 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HDAC1Q13547 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HDAC1Q13547 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HDAC1Q13547 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HDAC1Q13547 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HDAC1Q13547 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HDAC1Q13547 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HDAC1Q13547 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HDAC1Q13547 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HDAC1Q13547 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HDAC1Q13547 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HDAC1Q13547 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HDAC1Q13547 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HDAC1Q13547 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HDAC1Q13547 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HDAC1Q13547 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HDAC1Q13547 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HDAC1Q13547 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HDAC1Q13547 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HDAC1Q13547 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HDAC1Q13547 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HDAC1Q13547 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HDAC1Q13547 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HDAC1Q13547 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HDAC1Q13547 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HDAC1Q13547 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HDAC1Q13547 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HDAC1Q13547 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HDAC1Q13547 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HDAC1Q13547 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HDAC1Q13547 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HDAC1Q13547 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
HDAC1Q13547 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
HDAC1Q13547 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HDAC1Q13547 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HDAC1Q13547 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HDAC1Q13547 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HDAC1Q13547 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HDAC1Q13547 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HDAC1Q13547 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HDAC1Q13547 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HDAC1Q13547 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HDAC1Q13547 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HDAC1Q13547 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HDAC1Q13547 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HDAC1Q13547 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HDAC1Q13547 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HDAC1Q13547 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HDAC1Q13547 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HDAC1Q13547 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HDAC1Q13547 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HDAC1Q13547 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HDAC1Q13547 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HDAC1Q13547 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HDAC1Q13547 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HDAC1Q13547 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HDAC1Q13547 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HDAC1Q13547 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HDAC1Q13547 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HDAC1Q13547 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HDAC1Q13547 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HDAC1Q13547 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HDAC1Q13547 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
HDAC1Q13547 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
HDAC1Q13547 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HDAC1Q13547 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HDAC1Q13547 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HDAC1Q13547 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HDAC1Q13547 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HDAC1Q13547 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HDAC1Q13547 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HDAC1Q13547 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HDAC1Q13547 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HDAC1Q13547 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HDAC1Q13547 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HDAC1Q13547 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HDAC1Q13547 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HDAC1Q13547 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HDAC1Q13547 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC22■■□□□ 1.11
HDAC1Q13547 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HDAC1Q13547 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HDAC1Q13547 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HDAC1Q13547 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HDAC1Q13547 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
HDAC1Q13547 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HDAC1Q13547 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HDAC1Q13547 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HDAC1Q13547 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
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