Protein–RNA interactions for Protein: Q13351

KLF1, Krueppel-like factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 362 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF1Q13351 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLF1Q13351 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
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