Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SP140Q13342 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
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SP140Q13342 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SP140Q13342 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SP140Q13342 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SP140Q13342 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SP140Q13342 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SP140Q13342 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SP140Q13342 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SP140Q13342 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SP140Q13342 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SP140Q13342 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SP140Q13342 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SP140Q13342 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SP140Q13342 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SP140Q13342 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SP140Q13342 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SP140Q13342 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
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SP140Q13342 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SP140Q13342 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SP140Q13342 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SP140Q13342 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SP140Q13342 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SP140Q13342 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SP140Q13342 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
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SP140Q13342 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SP140Q13342 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SP140Q13342 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SP140Q13342 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SP140Q13342 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SP140Q13342 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SP140Q13342 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
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SP140Q13342 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
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SP140Q13342 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SP140Q13342 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SP140Q13342 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SP140Q13342 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SP140Q13342 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SP140Q13342 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SP140Q13342 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SP140Q13342 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SP140Q13342 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SP140Q13342 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SP140Q13342 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SP140Q13342 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SP140Q13342 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SP140Q13342 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SP140Q13342 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SP140Q13342 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SP140Q13342 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SP140Q13342 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SP140Q13342 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SP140Q13342 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SP140Q13342 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SP140Q13342 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SP140Q13342 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SP140Q13342 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
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