Protein–RNA interactions for Protein: Q13258

PTGDR, Prostaglandin D2 receptor, humanhuman

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDRQ13258 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTGDRQ13258 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTGDRQ13258 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTGDRQ13258 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PTGDRQ13258 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTGDRQ13258 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTGDRQ13258 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTGDRQ13258 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTGDRQ13258 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTGDRQ13258 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTGDRQ13258 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTGDRQ13258 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTGDRQ13258 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PTGDRQ13258 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTGDRQ13258 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTGDRQ13258 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTGDRQ13258 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTGDRQ13258 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTGDRQ13258 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTGDRQ13258 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTGDRQ13258 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTGDRQ13258 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTGDRQ13258 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTGDRQ13258 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTGDRQ13258 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTGDRQ13258 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTGDRQ13258 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTGDRQ13258 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTGDRQ13258 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTGDRQ13258 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTGDRQ13258 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTGDRQ13258 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTGDRQ13258 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTGDRQ13258 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTGDRQ13258 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTGDRQ13258 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTGDRQ13258 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTGDRQ13258 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTGDRQ13258 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTGDRQ13258 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTGDRQ13258 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTGDRQ13258 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PTGDRQ13258 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTGDRQ13258 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTGDRQ13258 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTGDRQ13258 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTGDRQ13258 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTGDRQ13258 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTGDRQ13258 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTGDRQ13258 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTGDRQ13258 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTGDRQ13258 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTGDRQ13258 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTGDRQ13258 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTGDRQ13258 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTGDRQ13258 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTGDRQ13258 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTGDRQ13258 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTGDRQ13258 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTGDRQ13258 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTGDRQ13258 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTGDRQ13258 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTGDRQ13258 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PTGDRQ13258 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PTGDRQ13258 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTGDRQ13258 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTGDRQ13258 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTGDRQ13258 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTGDRQ13258 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTGDRQ13258 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTGDRQ13258 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTGDRQ13258 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTGDRQ13258 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTGDRQ13258 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTGDRQ13258 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTGDRQ13258 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTGDRQ13258 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTGDRQ13258 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTGDRQ13258 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTGDRQ13258 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTGDRQ13258 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTGDRQ13258 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTGDRQ13258 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTGDRQ13258 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTGDRQ13258 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTGDRQ13258 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PTGDRQ13258 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTGDRQ13258 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTGDRQ13258 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTGDRQ13258 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTGDRQ13258 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTGDRQ13258 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTGDRQ13258 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PTGDRQ13258 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTGDRQ13258 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTGDRQ13258 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTGDRQ13258 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTGDRQ13258 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTGDRQ13258 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PTGDRQ13258 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
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