Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHAF1BQ13112 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHAF1BQ13112 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHAF1BQ13112 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHAF1BQ13112 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHAF1BQ13112 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHAF1BQ13112 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHAF1BQ13112 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHAF1BQ13112 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHAF1BQ13112 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHAF1BQ13112 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHAF1BQ13112 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHAF1BQ13112 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHAF1BQ13112 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHAF1BQ13112 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CHAF1BQ13112 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHAF1BQ13112 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CHAF1BQ13112 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHAF1BQ13112 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHAF1BQ13112 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHAF1BQ13112 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHAF1BQ13112 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHAF1BQ13112 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHAF1BQ13112 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHAF1BQ13112 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHAF1BQ13112 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHAF1BQ13112 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHAF1BQ13112 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHAF1BQ13112 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHAF1BQ13112 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHAF1BQ13112 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHAF1BQ13112 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHAF1BQ13112 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHAF1BQ13112 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHAF1BQ13112 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHAF1BQ13112 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHAF1BQ13112 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHAF1BQ13112 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHAF1BQ13112 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHAF1BQ13112 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHAF1BQ13112 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHAF1BQ13112 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHAF1BQ13112 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHAF1BQ13112 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHAF1BQ13112 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHAF1BQ13112 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CHAF1BQ13112 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CHAF1BQ13112 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHAF1BQ13112 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHAF1BQ13112 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHAF1BQ13112 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHAF1BQ13112 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHAF1BQ13112 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHAF1BQ13112 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CHAF1BQ13112 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHAF1BQ13112 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CHAF1BQ13112 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHAF1BQ13112 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CHAF1BQ13112 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHAF1BQ13112 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHAF1BQ13112 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHAF1BQ13112 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHAF1BQ13112 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHAF1BQ13112 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHAF1BQ13112 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHAF1BQ13112 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHAF1BQ13112 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHAF1BQ13112 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHAF1BQ13112 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHAF1BQ13112 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHAF1BQ13112 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHAF1BQ13112 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHAF1BQ13112 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHAF1BQ13112 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHAF1BQ13112 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHAF1BQ13112 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHAF1BQ13112 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHAF1BQ13112 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHAF1BQ13112 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHAF1BQ13112 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHAF1BQ13112 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHAF1BQ13112 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHAF1BQ13112 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHAF1BQ13112 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CHAF1BQ13112 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHAF1BQ13112 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CHAF1BQ13112 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHAF1BQ13112 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHAF1BQ13112 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHAF1BQ13112 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHAF1BQ13112 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHAF1BQ13112 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHAF1BQ13112 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHAF1BQ13112 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHAF1BQ13112 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHAF1BQ13112 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHAF1BQ13112 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHAF1BQ13112 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHAF1BQ13112 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHAF1BQ13112 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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