Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHAF1AQ13111 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHAF1AQ13111 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHAF1AQ13111 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHAF1AQ13111 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHAF1AQ13111 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHAF1AQ13111 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHAF1AQ13111 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHAF1AQ13111 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHAF1AQ13111 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHAF1AQ13111 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHAF1AQ13111 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHAF1AQ13111 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHAF1AQ13111 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHAF1AQ13111 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHAF1AQ13111 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHAF1AQ13111 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHAF1AQ13111 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHAF1AQ13111 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHAF1AQ13111 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHAF1AQ13111 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHAF1AQ13111 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CHAF1AQ13111 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CHAF1AQ13111 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHAF1AQ13111 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CHAF1AQ13111 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CHAF1AQ13111 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHAF1AQ13111 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHAF1AQ13111 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHAF1AQ13111 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHAF1AQ13111 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHAF1AQ13111 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHAF1AQ13111 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHAF1AQ13111 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHAF1AQ13111 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHAF1AQ13111 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHAF1AQ13111 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHAF1AQ13111 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHAF1AQ13111 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHAF1AQ13111 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHAF1AQ13111 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHAF1AQ13111 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHAF1AQ13111 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHAF1AQ13111 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHAF1AQ13111 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHAF1AQ13111 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHAF1AQ13111 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHAF1AQ13111 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHAF1AQ13111 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHAF1AQ13111 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHAF1AQ13111 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHAF1AQ13111 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHAF1AQ13111 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHAF1AQ13111 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHAF1AQ13111 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHAF1AQ13111 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHAF1AQ13111 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHAF1AQ13111 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHAF1AQ13111 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHAF1AQ13111 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHAF1AQ13111 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHAF1AQ13111 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CHAF1AQ13111 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHAF1AQ13111 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHAF1AQ13111 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHAF1AQ13111 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHAF1AQ13111 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHAF1AQ13111 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHAF1AQ13111 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHAF1AQ13111 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHAF1AQ13111 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHAF1AQ13111 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHAF1AQ13111 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHAF1AQ13111 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHAF1AQ13111 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHAF1AQ13111 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHAF1AQ13111 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHAF1AQ13111 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHAF1AQ13111 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHAF1AQ13111 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHAF1AQ13111 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHAF1AQ13111 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHAF1AQ13111 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHAF1AQ13111 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHAF1AQ13111 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHAF1AQ13111 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHAF1AQ13111 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHAF1AQ13111 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHAF1AQ13111 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHAF1AQ13111 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CHAF1AQ13111 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHAF1AQ13111 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CHAF1AQ13111 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHAF1AQ13111 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHAF1AQ13111 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHAF1AQ13111 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHAF1AQ13111 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHAF1AQ13111 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHAF1AQ13111 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHAF1AQ13111 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
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