Protein–RNA interactions for Protein: Q13061

TRDN, Triadin, humanhuman

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Length 729 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDNQ13061 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRDNQ13061 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRDNQ13061 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRDNQ13061 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRDNQ13061 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRDNQ13061 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRDNQ13061 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRDNQ13061 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRDNQ13061 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRDNQ13061 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRDNQ13061 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRDNQ13061 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRDNQ13061 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRDNQ13061 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRDNQ13061 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRDNQ13061 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRDNQ13061 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TRDNQ13061 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
TRDNQ13061 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TRDNQ13061 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRDNQ13061 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TRDNQ13061 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRDNQ13061 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRDNQ13061 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRDNQ13061 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TRDNQ13061 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRDNQ13061 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRDNQ13061 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRDNQ13061 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRDNQ13061 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TRDNQ13061 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRDNQ13061 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRDNQ13061 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRDNQ13061 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRDNQ13061 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRDNQ13061 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRDNQ13061 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRDNQ13061 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRDNQ13061 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRDNQ13061 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRDNQ13061 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRDNQ13061 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRDNQ13061 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRDNQ13061 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRDNQ13061 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRDNQ13061 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TRDNQ13061 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRDNQ13061 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRDNQ13061 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRDNQ13061 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRDNQ13061 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRDNQ13061 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRDNQ13061 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRDNQ13061 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRDNQ13061 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRDNQ13061 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRDNQ13061 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRDNQ13061 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRDNQ13061 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRDNQ13061 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRDNQ13061 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRDNQ13061 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRDNQ13061 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
TRDNQ13061 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRDNQ13061 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRDNQ13061 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRDNQ13061 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRDNQ13061 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRDNQ13061 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRDNQ13061 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRDNQ13061 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRDNQ13061 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRDNQ13061 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRDNQ13061 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRDNQ13061 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRDNQ13061 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRDNQ13061 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRDNQ13061 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRDNQ13061 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRDNQ13061 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRDNQ13061 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRDNQ13061 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
TRDNQ13061 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRDNQ13061 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRDNQ13061 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRDNQ13061 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRDNQ13061 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRDNQ13061 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRDNQ13061 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRDNQ13061 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRDNQ13061 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRDNQ13061 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRDNQ13061 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
TRDNQ13061 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
TRDNQ13061 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRDNQ13061 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRDNQ13061 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRDNQ13061 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
TRDNQ13061 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRDNQ13061 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
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