Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAF2Q12933 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAF2Q12933 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAF2Q12933 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAF2Q12933 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAF2Q12933 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAF2Q12933 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAF2Q12933 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRAF2Q12933 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAF2Q12933 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAF2Q12933 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAF2Q12933 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAF2Q12933 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAF2Q12933 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAF2Q12933 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAF2Q12933 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAF2Q12933 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAF2Q12933 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAF2Q12933 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAF2Q12933 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAF2Q12933 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAF2Q12933 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAF2Q12933 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAF2Q12933 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAF2Q12933 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAF2Q12933 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAF2Q12933 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAF2Q12933 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRAF2Q12933 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRAF2Q12933 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRAF2Q12933 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRAF2Q12933 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRAF2Q12933 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRAF2Q12933 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRAF2Q12933 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRAF2Q12933 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAF2Q12933 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAF2Q12933 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAF2Q12933 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAF2Q12933 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAF2Q12933 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAF2Q12933 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAF2Q12933 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAF2Q12933 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAF2Q12933 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAF2Q12933 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAF2Q12933 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAF2Q12933 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAF2Q12933 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAF2Q12933 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAF2Q12933 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAF2Q12933 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAF2Q12933 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAF2Q12933 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAF2Q12933 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAF2Q12933 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAF2Q12933 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAF2Q12933 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAF2Q12933 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAF2Q12933 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAF2Q12933 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAF2Q12933 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAF2Q12933 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAF2Q12933 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAF2Q12933 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAF2Q12933 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAF2Q12933 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAF2Q12933 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAF2Q12933 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAF2Q12933 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAF2Q12933 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAF2Q12933 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAF2Q12933 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAF2Q12933 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRAF2Q12933 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TRAF2Q12933 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TRAF2Q12933 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRAF2Q12933 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRAF2Q12933 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TRAF2Q12933 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TRAF2Q12933 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRAF2Q12933 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRAF2Q12933 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRAF2Q12933 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRAF2Q12933 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRAF2Q12933 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRAF2Q12933 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRAF2Q12933 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRAF2Q12933 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TRAF2Q12933 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TRAF2Q12933 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TRAF2Q12933 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TRAF2Q12933 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TRAF2Q12933 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TRAF2Q12933 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRAF2Q12933 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TRAF2Q12933 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TRAF2Q12933 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRAF2Q12933 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TRAF2Q12933 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.1 ms