Protein–RNA interactions for Protein: Q12887

COX10, Protoheme IX farnesyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX10Q12887 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
COX10Q12887 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COX10Q12887 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COX10Q12887 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COX10Q12887 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COX10Q12887 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COX10Q12887 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COX10Q12887 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COX10Q12887 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COX10Q12887 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COX10Q12887 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COX10Q12887 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COX10Q12887 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COX10Q12887 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COX10Q12887 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COX10Q12887 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COX10Q12887 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COX10Q12887 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COX10Q12887 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COX10Q12887 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COX10Q12887 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COX10Q12887 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COX10Q12887 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COX10Q12887 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
COX10Q12887 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
COX10Q12887 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COX10Q12887 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COX10Q12887 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
COX10Q12887 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COX10Q12887 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
COX10Q12887 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COX10Q12887 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COX10Q12887 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COX10Q12887 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COX10Q12887 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COX10Q12887 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COX10Q12887 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COX10Q12887 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COX10Q12887 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COX10Q12887 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COX10Q12887 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COX10Q12887 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
COX10Q12887 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COX10Q12887 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COX10Q12887 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COX10Q12887 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COX10Q12887 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COX10Q12887 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COX10Q12887 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COX10Q12887 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COX10Q12887 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COX10Q12887 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COX10Q12887 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COX10Q12887 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COX10Q12887 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COX10Q12887 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COX10Q12887 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COX10Q12887 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COX10Q12887 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COX10Q12887 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COX10Q12887 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COX10Q12887 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COX10Q12887 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COX10Q12887 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COX10Q12887 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COX10Q12887 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COX10Q12887 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COX10Q12887 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COX10Q12887 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COX10Q12887 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COX10Q12887 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COX10Q12887 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COX10Q12887 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COX10Q12887 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COX10Q12887 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COX10Q12887 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COX10Q12887 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COX10Q12887 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
COX10Q12887 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COX10Q12887 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COX10Q12887 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COX10Q12887 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COX10Q12887 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COX10Q12887 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COX10Q12887 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
COX10Q12887 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COX10Q12887 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COX10Q12887 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COX10Q12887 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COX10Q12887 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COX10Q12887 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COX10Q12887 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COX10Q12887 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COX10Q12887 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
COX10Q12887 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COX10Q12887 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COX10Q12887 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COX10Q12887 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COX10Q12887 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COX10Q12887 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms