Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BPTFQ12830 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BPTFQ12830 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BPTFQ12830 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BPTFQ12830 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BPTFQ12830 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BPTFQ12830 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BPTFQ12830 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BPTFQ12830 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BPTFQ12830 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BPTFQ12830 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BPTFQ12830 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BPTFQ12830 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BPTFQ12830 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BPTFQ12830 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BPTFQ12830 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BPTFQ12830 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BPTFQ12830 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BPTFQ12830 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BPTFQ12830 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BPTFQ12830 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
BPTFQ12830 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BPTFQ12830 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BPTFQ12830 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BPTFQ12830 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
BPTFQ12830 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BPTFQ12830 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BPTFQ12830 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
BPTFQ12830 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
BPTFQ12830 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BPTFQ12830 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BPTFQ12830 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BPTFQ12830 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BPTFQ12830 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BPTFQ12830 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BPTFQ12830 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BPTFQ12830 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BPTFQ12830 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BPTFQ12830 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BPTFQ12830 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BPTFQ12830 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BPTFQ12830 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BPTFQ12830 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BPTFQ12830 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BPTFQ12830 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BPTFQ12830 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BPTFQ12830 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BPTFQ12830 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BPTFQ12830 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BPTFQ12830 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BPTFQ12830 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BPTFQ12830 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BPTFQ12830 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
BPTFQ12830 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BPTFQ12830 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BPTFQ12830 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BPTFQ12830 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BPTFQ12830 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
BPTFQ12830 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
BPTFQ12830 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BPTFQ12830 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
BPTFQ12830 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BPTFQ12830 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BPTFQ12830 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
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