Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CACNB2Q08289 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
CACNB2Q08289 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
CACNB2Q08289 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CACNB2Q08289 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CACNB2Q08289 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CACNB2Q08289 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CACNB2Q08289 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CACNB2Q08289 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CACNB2Q08289 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CACNB2Q08289 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CACNB2Q08289 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CACNB2Q08289 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
CACNB2Q08289 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CACNB2Q08289 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CACNB2Q08289 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CACNB2Q08289 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CACNB2Q08289 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CACNB2Q08289 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CACNB2Q08289 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CACNB2Q08289 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CACNB2Q08289 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CACNB2Q08289 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CACNB2Q08289 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CACNB2Q08289 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CACNB2Q08289 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CACNB2Q08289 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CACNB2Q08289 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CACNB2Q08289 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CACNB2Q08289 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CACNB2Q08289 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CACNB2Q08289 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CACNB2Q08289 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CACNB2Q08289 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CACNB2Q08289 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CACNB2Q08289 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
CACNB2Q08289 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CACNB2Q08289 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CACNB2Q08289 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CACNB2Q08289 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CACNB2Q08289 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CACNB2Q08289 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CACNB2Q08289 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CACNB2Q08289 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
CACNB2Q08289 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CACNB2Q08289 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CACNB2Q08289 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CACNB2Q08289 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
CACNB2Q08289 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CACNB2Q08289 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CACNB2Q08289 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
CACNB2Q08289 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CACNB2Q08289 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CACNB2Q08289 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CACNB2Q08289 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CACNB2Q08289 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CACNB2Q08289 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CACNB2Q08289 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CACNB2Q08289 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CACNB2Q08289 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CACNB2Q08289 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CACNB2Q08289 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CACNB2Q08289 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CACNB2Q08289 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CACNB2Q08289 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CACNB2Q08289 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CACNB2Q08289 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CACNB2Q08289 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CACNB2Q08289 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
CACNB2Q08289 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
CACNB2Q08289 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CACNB2Q08289 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
CACNB2Q08289 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CACNB2Q08289 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CACNB2Q08289 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CACNB2Q08289 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CACNB2Q08289 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CACNB2Q08289 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CACNB2Q08289 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CACNB2Q08289 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CACNB2Q08289 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CACNB2Q08289 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CACNB2Q08289 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CACNB2Q08289 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CACNB2Q08289 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CACNB2Q08289 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CACNB2Q08289 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CACNB2Q08289 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CACNB2Q08289 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CACNB2Q08289 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CACNB2Q08289 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CACNB2Q08289 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CACNB2Q08289 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CACNB2Q08289 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
CACNB2Q08289 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CACNB2Q08289 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CACNB2Q08289 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CACNB2Q08289 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CACNB2Q08289 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CACNB2Q08289 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms