Protein–RNA interactions for Protein: Q07627

KRTAP1-1, Keratin-associated protein 1-1, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-1Q07627 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
KRTAP1-1Q07627 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
KRTAP1-1Q07627 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
KRTAP1-1Q07627 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
KRTAP1-1Q07627 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
KRTAP1-1Q07627 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
KRTAP1-1Q07627 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
KRTAP1-1Q07627 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
KRTAP1-1Q07627 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
KRTAP1-1Q07627 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
KRTAP1-1Q07627 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
KRTAP1-1Q07627 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
KRTAP1-1Q07627 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
KRTAP1-1Q07627 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
KRTAP1-1Q07627 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
KRTAP1-1Q07627 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
KRTAP1-1Q07627 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
KRTAP1-1Q07627 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
KRTAP1-1Q07627 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC14.21□□□□□ -0.13
KRTAP1-1Q07627 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
KRTAP1-1Q07627 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
KRTAP1-1Q07627 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
KRTAP1-1Q07627 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
KRTAP1-1Q07627 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
KRTAP1-1Q07627 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
KRTAP1-1Q07627 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
KRTAP1-1Q07627 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
KRTAP1-1Q07627 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
KRTAP1-1Q07627 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
KRTAP1-1Q07627 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
KRTAP1-1Q07627 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
KRTAP1-1Q07627 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
KRTAP1-1Q07627 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
KRTAP1-1Q07627 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
KRTAP1-1Q07627 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
KRTAP1-1Q07627 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
KRTAP1-1Q07627 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
KRTAP1-1Q07627 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
KRTAP1-1Q07627 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
KRTAP1-1Q07627 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
KRTAP1-1Q07627 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
KRTAP1-1Q07627 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
KRTAP1-1Q07627 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
KRTAP1-1Q07627 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
KRTAP1-1Q07627 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
KRTAP1-1Q07627 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
KRTAP1-1Q07627 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
KRTAP1-1Q07627 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
KRTAP1-1Q07627 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
KRTAP1-1Q07627 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
KRTAP1-1Q07627 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
KRTAP1-1Q07627 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
KRTAP1-1Q07627 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
KRTAP1-1Q07627 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
KRTAP1-1Q07627 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
KRTAP1-1Q07627 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
KRTAP1-1Q07627 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
KRTAP1-1Q07627 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
KRTAP1-1Q07627 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
KRTAP1-1Q07627 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
KRTAP1-1Q07627 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
KRTAP1-1Q07627 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
KRTAP1-1Q07627 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
KRTAP1-1Q07627 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
KRTAP1-1Q07627 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
KRTAP1-1Q07627 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
KRTAP1-1Q07627 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
KRTAP1-1Q07627 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
KRTAP1-1Q07627 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
KRTAP1-1Q07627 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
KRTAP1-1Q07627 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
KRTAP1-1Q07627 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
KRTAP1-1Q07627 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
KRTAP1-1Q07627 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
KRTAP1-1Q07627 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
KRTAP1-1Q07627 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
KRTAP1-1Q07627 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
KRTAP1-1Q07627 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
KRTAP1-1Q07627 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
KRTAP1-1Q07627 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
KRTAP1-1Q07627 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
KRTAP1-1Q07627 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
KRTAP1-1Q07627 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
KRTAP1-1Q07627 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
KRTAP1-1Q07627 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
KRTAP1-1Q07627 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
KRTAP1-1Q07627 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
KRTAP1-1Q07627 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
KRTAP1-1Q07627 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
KRTAP1-1Q07627 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
KRTAP1-1Q07627 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
KRTAP1-1Q07627 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
KRTAP1-1Q07627 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
KRTAP1-1Q07627 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
KRTAP1-1Q07627 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
KRTAP1-1Q07627 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
KRTAP1-1Q07627 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
KRTAP1-1Q07627 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
KRTAP1-1Q07627 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.18□□□□□ -0.14
KRTAP1-1Q07627 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms