Protein–RNA interactions for Protein: Q07002

CDK18, Cyclin-dependent kinase 18, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK18Q07002 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK18Q07002 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK18Q07002 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK18Q07002 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDK18Q07002 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDK18Q07002 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDK18Q07002 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDK18Q07002 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDK18Q07002 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDK18Q07002 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDK18Q07002 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDK18Q07002 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms