Protein–RNA interactions for Protein: Q05655

PRKCD, Protein kinase C delta type, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCDQ05655 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKCDQ05655 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms