Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATP7AQ04656 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATP7AQ04656 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATP7AQ04656 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATP7AQ04656 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATP7AQ04656 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
ATP7AQ04656 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATP7AQ04656 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATP7AQ04656 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATP7AQ04656 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
ATP7AQ04656 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATP7AQ04656 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
ATP7AQ04656 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATP7AQ04656 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
ATP7AQ04656 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATP7AQ04656 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATP7AQ04656 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
ATP7AQ04656 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATP7AQ04656 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATP7AQ04656 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATP7AQ04656 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATP7AQ04656 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATP7AQ04656 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATP7AQ04656 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
ATP7AQ04656 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
ATP7AQ04656 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATP7AQ04656 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATP7AQ04656 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATP7AQ04656 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATP7AQ04656 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
ATP7AQ04656 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATP7AQ04656 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATP7AQ04656 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATP7AQ04656 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATP7AQ04656 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATP7AQ04656 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATP7AQ04656 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATP7AQ04656 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATP7AQ04656 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
ATP7AQ04656 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATP7AQ04656 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATP7AQ04656 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATP7AQ04656 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATP7AQ04656 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATP7AQ04656 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATP7AQ04656 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATP7AQ04656 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATP7AQ04656 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
ATP7AQ04656 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATP7AQ04656 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATP7AQ04656 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATP7AQ04656 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATP7AQ04656 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATP7AQ04656 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATP7AQ04656 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATP7AQ04656 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATP7AQ04656 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATP7AQ04656 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATP7AQ04656 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATP7AQ04656 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATP7AQ04656 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATP7AQ04656 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATP7AQ04656 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATP7AQ04656 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATP7AQ04656 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATP7AQ04656 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATP7AQ04656 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATP7AQ04656 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATP7AQ04656 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATP7AQ04656 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATP7AQ04656 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATP7AQ04656 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATP7AQ04656 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATP7AQ04656 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATP7AQ04656 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATP7AQ04656 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATP7AQ04656 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATP7AQ04656 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATP7AQ04656 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATP7AQ04656 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATP7AQ04656 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
ATP7AQ04656 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATP7AQ04656 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
ATP7AQ04656 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATP7AQ04656 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATP7AQ04656 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATP7AQ04656 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATP7AQ04656 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATP7AQ04656 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATP7AQ04656 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATP7AQ04656 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATP7AQ04656 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATP7AQ04656 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATP7AQ04656 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATP7AQ04656 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATP7AQ04656 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATP7AQ04656 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATP7AQ04656 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATP7AQ04656 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATP7AQ04656 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms