Protein–RNA interactions for Protein: Q02928

CYP4A11, Cytochrome P450 4A11, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4A11Q02928 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CYP4A11Q02928 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CYP4A11Q02928 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CYP4A11Q02928 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CYP4A11Q02928 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
CYP4A11Q02928 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
CYP4A11Q02928 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
CYP4A11Q02928 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CYP4A11Q02928 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CYP4A11Q02928 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CYP4A11Q02928 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CYP4A11Q02928 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CYP4A11Q02928 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CYP4A11Q02928 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CYP4A11Q02928 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CYP4A11Q02928 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CYP4A11Q02928 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CYP4A11Q02928 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CYP4A11Q02928 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CYP4A11Q02928 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CYP4A11Q02928 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CYP4A11Q02928 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CYP4A11Q02928 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CYP4A11Q02928 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CYP4A11Q02928 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CYP4A11Q02928 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CYP4A11Q02928 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CYP4A11Q02928 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CYP4A11Q02928 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CYP4A11Q02928 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CYP4A11Q02928 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CYP4A11Q02928 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CYP4A11Q02928 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CYP4A11Q02928 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CYP4A11Q02928 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CYP4A11Q02928 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CYP4A11Q02928 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CYP4A11Q02928 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CYP4A11Q02928 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CYP4A11Q02928 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CYP4A11Q02928 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CYP4A11Q02928 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CYP4A11Q02928 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CYP4A11Q02928 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CYP4A11Q02928 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CYP4A11Q02928 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CYP4A11Q02928 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CYP4A11Q02928 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CYP4A11Q02928 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CYP4A11Q02928 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CYP4A11Q02928 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CYP4A11Q02928 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CYP4A11Q02928 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CYP4A11Q02928 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CYP4A11Q02928 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CYP4A11Q02928 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CYP4A11Q02928 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CYP4A11Q02928 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CYP4A11Q02928 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CYP4A11Q02928 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CYP4A11Q02928 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CYP4A11Q02928 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CYP4A11Q02928 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CYP4A11Q02928 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CYP4A11Q02928 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CYP4A11Q02928 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CYP4A11Q02928 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CYP4A11Q02928 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CYP4A11Q02928 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CYP4A11Q02928 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CYP4A11Q02928 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CYP4A11Q02928 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CYP4A11Q02928 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CYP4A11Q02928 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CYP4A11Q02928 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CYP4A11Q02928 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CYP4A11Q02928 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CYP4A11Q02928 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CYP4A11Q02928 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CYP4A11Q02928 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CYP4A11Q02928 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CYP4A11Q02928 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CYP4A11Q02928 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CYP4A11Q02928 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CYP4A11Q02928 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CYP4A11Q02928 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CYP4A11Q02928 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CYP4A11Q02928 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CYP4A11Q02928 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CYP4A11Q02928 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CYP4A11Q02928 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CYP4A11Q02928 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CYP4A11Q02928 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CYP4A11Q02928 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CYP4A11Q02928 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CYP4A11Q02928 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CYP4A11Q02928 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CYP4A11Q02928 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CYP4A11Q02928 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CYP4A11Q02928 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms