Protein–RNA interactions for Protein: Q02338

BDH1, D-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BDH1Q02338 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BDH1Q02338 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BDH1Q02338 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BDH1Q02338 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
BDH1Q02338 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BDH1Q02338 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BDH1Q02338 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
BDH1Q02338 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BDH1Q02338 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BDH1Q02338 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BDH1Q02338 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BDH1Q02338 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BDH1Q02338 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BDH1Q02338 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BDH1Q02338 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BDH1Q02338 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BDH1Q02338 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BDH1Q02338 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BDH1Q02338 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BDH1Q02338 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BDH1Q02338 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BDH1Q02338 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BDH1Q02338 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BDH1Q02338 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BDH1Q02338 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BDH1Q02338 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
BDH1Q02338 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BDH1Q02338 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BDH1Q02338 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BDH1Q02338 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BDH1Q02338 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BDH1Q02338 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
BDH1Q02338 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BDH1Q02338 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BDH1Q02338 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BDH1Q02338 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BDH1Q02338 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
BDH1Q02338 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BDH1Q02338 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BDH1Q02338 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BDH1Q02338 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BDH1Q02338 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BDH1Q02338 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BDH1Q02338 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BDH1Q02338 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BDH1Q02338 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BDH1Q02338 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BDH1Q02338 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BDH1Q02338 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BDH1Q02338 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BDH1Q02338 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BDH1Q02338 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BDH1Q02338 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BDH1Q02338 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BDH1Q02338 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BDH1Q02338 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BDH1Q02338 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BDH1Q02338 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BDH1Q02338 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BDH1Q02338 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BDH1Q02338 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BDH1Q02338 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BDH1Q02338 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BDH1Q02338 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BDH1Q02338 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BDH1Q02338 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BDH1Q02338 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BDH1Q02338 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BDH1Q02338 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BDH1Q02338 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BDH1Q02338 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BDH1Q02338 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BDH1Q02338 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BDH1Q02338 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BDH1Q02338 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BDH1Q02338 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BDH1Q02338 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BDH1Q02338 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BDH1Q02338 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BDH1Q02338 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BDH1Q02338 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BDH1Q02338 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BDH1Q02338 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BDH1Q02338 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BDH1Q02338 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BDH1Q02338 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BDH1Q02338 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BDH1Q02338 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BDH1Q02338 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BDH1Q02338 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BDH1Q02338 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
BDH1Q02338 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
BDH1Q02338 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BDH1Q02338 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BDH1Q02338 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
BDH1Q02338 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BDH1Q02338 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BDH1Q02338 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BDH1Q02338 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BDH1Q02338 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms