Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNFRSF17Q02223 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms