Protein–RNA interactions for Protein: Q02161

RHD, Blood group Rh(D) polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHDQ02161 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RHDQ02161 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RHDQ02161 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RHDQ02161 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RHDQ02161 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RHDQ02161 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RHDQ02161 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RHDQ02161 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RHDQ02161 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RHDQ02161 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RHDQ02161 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RHDQ02161 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RHDQ02161 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RHDQ02161 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RHDQ02161 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RHDQ02161 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RHDQ02161 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RHDQ02161 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RHDQ02161 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RHDQ02161 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RHDQ02161 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RHDQ02161 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RHDQ02161 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RHDQ02161 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RHDQ02161 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RHDQ02161 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RHDQ02161 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RHDQ02161 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RHDQ02161 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RHDQ02161 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RHDQ02161 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RHDQ02161 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RHDQ02161 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RHDQ02161 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RHDQ02161 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RHDQ02161 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RHDQ02161 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RHDQ02161 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RHDQ02161 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RHDQ02161 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RHDQ02161 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RHDQ02161 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RHDQ02161 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RHDQ02161 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RHDQ02161 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RHDQ02161 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RHDQ02161 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RHDQ02161 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RHDQ02161 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RHDQ02161 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RHDQ02161 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
RHDQ02161 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RHDQ02161 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RHDQ02161 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RHDQ02161 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RHDQ02161 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RHDQ02161 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RHDQ02161 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RHDQ02161 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RHDQ02161 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RHDQ02161 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RHDQ02161 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RHDQ02161 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RHDQ02161 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RHDQ02161 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RHDQ02161 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RHDQ02161 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RHDQ02161 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RHDQ02161 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RHDQ02161 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RHDQ02161 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RHDQ02161 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RHDQ02161 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RHDQ02161 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RHDQ02161 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RHDQ02161 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
RHDQ02161 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RHDQ02161 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RHDQ02161 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RHDQ02161 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
RHDQ02161 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RHDQ02161 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RHDQ02161 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
RHDQ02161 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RHDQ02161 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
RHDQ02161 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RHDQ02161 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
RHDQ02161 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RHDQ02161 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
RHDQ02161 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RHDQ02161 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RHDQ02161 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RHDQ02161 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RHDQ02161 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RHDQ02161 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RHDQ02161 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RHDQ02161 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RHDQ02161 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RHDQ02161 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RHDQ02161 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms