Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
E2F1Q01094 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
E2F1Q01094 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms