Protein–RNA interactions for Protein: Q00613

HSF1, Heat shock factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSF1Q00613 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HSF1Q00613 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HSF1Q00613 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HSF1Q00613 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HSF1Q00613 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HSF1Q00613 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HSF1Q00613 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HSF1Q00613 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HSF1Q00613 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HSF1Q00613 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HSF1Q00613 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
HSF1Q00613 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HSF1Q00613 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HSF1Q00613 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HSF1Q00613 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HSF1Q00613 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HSF1Q00613 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HSF1Q00613 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HSF1Q00613 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HSF1Q00613 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HSF1Q00613 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms