Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXC5Q00444 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms