Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMF1P82094 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMF1P82094 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TMF1P82094 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMF1P82094 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMF1P82094 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMF1P82094 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMF1P82094 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMF1P82094 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMF1P82094 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMF1P82094 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMF1P82094 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMF1P82094 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMF1P82094 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMF1P82094 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMF1P82094 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMF1P82094 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMF1P82094 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMF1P82094 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMF1P82094 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMF1P82094 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TMF1P82094 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMF1P82094 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TMF1P82094 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TMF1P82094 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMF1P82094 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMF1P82094 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMF1P82094 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMF1P82094 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TMF1P82094 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMF1P82094 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMF1P82094 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMF1P82094 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMF1P82094 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMF1P82094 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMF1P82094 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMF1P82094 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TMF1P82094 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMF1P82094 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMF1P82094 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMF1P82094 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TMF1P82094 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMF1P82094 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMF1P82094 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMF1P82094 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMF1P82094 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMF1P82094 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMF1P82094 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMF1P82094 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TMF1P82094 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMF1P82094 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TMF1P82094 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMF1P82094 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMF1P82094 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMF1P82094 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMF1P82094 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMF1P82094 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMF1P82094 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMF1P82094 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMF1P82094 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMF1P82094 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMF1P82094 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMF1P82094 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMF1P82094 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMF1P82094 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMF1P82094 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMF1P82094 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMF1P82094 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMF1P82094 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMF1P82094 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TMF1P82094 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TMF1P82094 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TMF1P82094 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMF1P82094 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TMF1P82094 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMF1P82094 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMF1P82094 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TMF1P82094 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMF1P82094 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMF1P82094 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMF1P82094 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMF1P82094 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TMF1P82094 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMF1P82094 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMF1P82094 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TMF1P82094 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMF1P82094 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMF1P82094 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMF1P82094 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMF1P82094 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMF1P82094 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMF1P82094 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMF1P82094 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TMF1P82094 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TMF1P82094 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMF1P82094 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMF1P82094 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMF1P82094 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMF1P82094 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMF1P82094 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms