Protein–RNA interactions for Protein: P78539

SRPX, Sushi repeat-containing protein SRPX, humanhuman

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SRPXP78539 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SRPXP78539 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
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SRPXP78539 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRPXP78539 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRPXP78539 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRPXP78539 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRPXP78539 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRPXP78539 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRPXP78539 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRPXP78539 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRPXP78539 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRPXP78539 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRPXP78539 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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SRPXP78539 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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SRPXP78539 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRPXP78539 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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SRPXP78539 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRPXP78539 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRPXP78539 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRPXP78539 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRPXP78539 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRPXP78539 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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SRPXP78539 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRPXP78539 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRPXP78539 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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SRPXP78539 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRPXP78539 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRPXP78539 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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SRPXP78539 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRPXP78539 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRPXP78539 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRPXP78539 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRPXP78539 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRPXP78539 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRPXP78539 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRPXP78539 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRPXP78539 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRPXP78539 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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