Protein–RNA interactions for Protein: P78337

PITX1, Pituitary homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1P78337 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PITX1P78337 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PITX1P78337 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PITX1P78337 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PITX1P78337 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PITX1P78337 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PITX1P78337 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PITX1P78337 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PITX1P78337 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PITX1P78337 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PITX1P78337 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PITX1P78337 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PITX1P78337 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PITX1P78337 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PITX1P78337 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PITX1P78337 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PITX1P78337 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PITX1P78337 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PITX1P78337 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PITX1P78337 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PITX1P78337 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PITX1P78337 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PITX1P78337 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PITX1P78337 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PITX1P78337 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PITX1P78337 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PITX1P78337 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PITX1P78337 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PITX1P78337 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PITX1P78337 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PITX1P78337 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PITX1P78337 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PITX1P78337 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PITX1P78337 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PITX1P78337 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PITX1P78337 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PITX1P78337 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PITX1P78337 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PITX1P78337 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PITX1P78337 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PITX1P78337 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PITX1P78337 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PITX1P78337 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PITX1P78337 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PITX1P78337 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PITX1P78337 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PITX1P78337 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PITX1P78337 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PITX1P78337 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PITX1P78337 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PITX1P78337 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PITX1P78337 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PITX1P78337 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PITX1P78337 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PITX1P78337 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PITX1P78337 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PITX1P78337 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PITX1P78337 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PITX1P78337 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PITX1P78337 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PITX1P78337 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PITX1P78337 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PITX1P78337 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PITX1P78337 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PITX1P78337 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PITX1P78337 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PITX1P78337 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PITX1P78337 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PITX1P78337 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PITX1P78337 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PITX1P78337 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PITX1P78337 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PITX1P78337 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PITX1P78337 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PITX1P78337 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PITX1P78337 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PITX1P78337 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PITX1P78337 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PITX1P78337 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PITX1P78337 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PITX1P78337 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PITX1P78337 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PITX1P78337 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PITX1P78337 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PITX1P78337 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PITX1P78337 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PITX1P78337 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PITX1P78337 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PITX1P78337 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PITX1P78337 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PITX1P78337 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PITX1P78337 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PITX1P78337 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PITX1P78337 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PITX1P78337 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PITX1P78337 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PITX1P78337 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PITX1P78337 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PITX1P78337 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PITX1P78337 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms