Protein–RNA interactions for Protein: P61565

ERVK-21, Endogenous retrovirus group K member 21 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-21P61565 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVK-21P61565 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVK-21P61565 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVK-21P61565 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVK-21P61565 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVK-21P61565 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVK-21P61565 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVK-21P61565 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVK-21P61565 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVK-21P61565 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVK-21P61565 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVK-21P61565 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVK-21P61565 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVK-21P61565 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVK-21P61565 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVK-21P61565 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVK-21P61565 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVK-21P61565 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVK-21P61565 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVK-21P61565 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVK-21P61565 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVK-21P61565 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVK-21P61565 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVK-21P61565 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVK-21P61565 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVK-21P61565 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVK-21P61565 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVK-21P61565 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVK-21P61565 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVK-21P61565 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVK-21P61565 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVK-21P61565 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVK-21P61565 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVK-21P61565 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVK-21P61565 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVK-21P61565 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVK-21P61565 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVK-21P61565 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVK-21P61565 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVK-21P61565 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVK-21P61565 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVK-21P61565 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ERVK-21P61565 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVK-21P61565 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVK-21P61565 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVK-21P61565 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVK-21P61565 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVK-21P61565 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVK-21P61565 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVK-21P61565 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVK-21P61565 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVK-21P61565 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVK-21P61565 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVK-21P61565 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVK-21P61565 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVK-21P61565 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVK-21P61565 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVK-21P61565 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVK-21P61565 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVK-21P61565 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVK-21P61565 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVK-21P61565 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVK-21P61565 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVK-21P61565 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVK-21P61565 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVK-21P61565 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVK-21P61565 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVK-21P61565 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVK-21P61565 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVK-21P61565 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ERVK-21P61565 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVK-21P61565 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVK-21P61565 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVK-21P61565 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVK-21P61565 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVK-21P61565 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVK-21P61565 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVK-21P61565 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVK-21P61565 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVK-21P61565 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVK-21P61565 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVK-21P61565 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVK-21P61565 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVK-21P61565 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVK-21P61565 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVK-21P61565 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVK-21P61565 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVK-21P61565 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVK-21P61565 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVK-21P61565 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ERVK-21P61565 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVK-21P61565 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVK-21P61565 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVK-21P61565 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVK-21P61565 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVK-21P61565 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVK-21P61565 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVK-21P61565 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVK-21P61565 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ERVK-21P61565 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms