Protein–RNA interactions for Protein: P61009

SPCS3, Signal peptidase complex subunit 3, humanhuman

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Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS3P61009 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPCS3P61009 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPCS3P61009 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPCS3P61009 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPCS3P61009 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPCS3P61009 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPCS3P61009 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPCS3P61009 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPCS3P61009 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPCS3P61009 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPCS3P61009 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPCS3P61009 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPCS3P61009 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPCS3P61009 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPCS3P61009 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPCS3P61009 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SPCS3P61009 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPCS3P61009 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPCS3P61009 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPCS3P61009 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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SPCS3P61009 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPCS3P61009 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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SPCS3P61009 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPCS3P61009 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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SPCS3P61009 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPCS3P61009 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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SPCS3P61009 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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SPCS3P61009 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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SPCS3P61009 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPCS3P61009 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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SPCS3P61009 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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SPCS3P61009 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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SPCS3P61009 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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SPCS3P61009 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPCS3P61009 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPCS3P61009 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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SPCS3P61009 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPCS3P61009 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPCS3P61009 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPCS3P61009 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPCS3P61009 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPCS3P61009 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SPCS3P61009 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SPCS3P61009 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SPCS3P61009 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SPCS3P61009 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SPCS3P61009 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SPCS3P61009 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SPCS3P61009 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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