Protein–RNA interactions for Protein: P57723

PCBP4, Poly(rC)-binding protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP4P57723 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCBP4P57723 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCBP4P57723 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCBP4P57723 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCBP4P57723 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCBP4P57723 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCBP4P57723 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCBP4P57723 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCBP4P57723 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCBP4P57723 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCBP4P57723 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCBP4P57723 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCBP4P57723 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PCBP4P57723 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCBP4P57723 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCBP4P57723 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCBP4P57723 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCBP4P57723 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCBP4P57723 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCBP4P57723 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCBP4P57723 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCBP4P57723 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCBP4P57723 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCBP4P57723 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCBP4P57723 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCBP4P57723 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCBP4P57723 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCBP4P57723 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCBP4P57723 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCBP4P57723 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCBP4P57723 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCBP4P57723 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCBP4P57723 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCBP4P57723 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCBP4P57723 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCBP4P57723 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCBP4P57723 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCBP4P57723 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PCBP4P57723 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCBP4P57723 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCBP4P57723 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCBP4P57723 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCBP4P57723 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCBP4P57723 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PCBP4P57723 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCBP4P57723 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCBP4P57723 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCBP4P57723 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCBP4P57723 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCBP4P57723 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCBP4P57723 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCBP4P57723 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCBP4P57723 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCBP4P57723 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCBP4P57723 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCBP4P57723 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCBP4P57723 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCBP4P57723 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCBP4P57723 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCBP4P57723 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCBP4P57723 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCBP4P57723 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCBP4P57723 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCBP4P57723 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCBP4P57723 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCBP4P57723 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PCBP4P57723 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCBP4P57723 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCBP4P57723 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCBP4P57723 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCBP4P57723 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCBP4P57723 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCBP4P57723 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCBP4P57723 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCBP4P57723 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCBP4P57723 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCBP4P57723 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCBP4P57723 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCBP4P57723 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCBP4P57723 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCBP4P57723 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCBP4P57723 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCBP4P57723 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCBP4P57723 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCBP4P57723 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCBP4P57723 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PCBP4P57723 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCBP4P57723 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCBP4P57723 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PCBP4P57723 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PCBP4P57723 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCBP4P57723 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PCBP4P57723 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCBP4P57723 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCBP4P57723 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PCBP4P57723 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCBP4P57723 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCBP4P57723 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCBP4P57723 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCBP4P57723 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms