Protein–RNA interactions for Protein: P56750

CLDN17, Claudin-17, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN17P56750 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLDN17P56750 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CLDN17P56750 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLDN17P56750 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLDN17P56750 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLDN17P56750 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLDN17P56750 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLDN17P56750 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLDN17P56750 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLDN17P56750 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLDN17P56750 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLDN17P56750 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CLDN17P56750 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLDN17P56750 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLDN17P56750 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLDN17P56750 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLDN17P56750 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLDN17P56750 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLDN17P56750 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLDN17P56750 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLDN17P56750 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLDN17P56750 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLDN17P56750 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CLDN17P56750 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLDN17P56750 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLDN17P56750 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLDN17P56750 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLDN17P56750 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLDN17P56750 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLDN17P56750 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN17P56750 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN17P56750 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN17P56750 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN17P56750 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN17P56750 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN17P56750 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN17P56750 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN17P56750 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN17P56750 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN17P56750 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN17P56750 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN17P56750 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN17P56750 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN17P56750 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN17P56750 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN17P56750 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN17P56750 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN17P56750 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN17P56750 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN17P56750 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN17P56750 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN17P56750 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN17P56750 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN17P56750 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLDN17P56750 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN17P56750 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN17P56750 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN17P56750 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN17P56750 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN17P56750 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN17P56750 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN17P56750 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN17P56750 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN17P56750 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN17P56750 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN17P56750 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN17P56750 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN17P56750 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN17P56750 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN17P56750 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN17P56750 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN17P56750 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN17P56750 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN17P56750 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN17P56750 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN17P56750 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN17P56750 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN17P56750 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN17P56750 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN17P56750 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN17P56750 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN17P56750 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN17P56750 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN17P56750 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN17P56750 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN17P56750 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN17P56750 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN17P56750 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN17P56750 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN17P56750 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLDN17P56750 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLDN17P56750 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLDN17P56750 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLDN17P56750 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLDN17P56750 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLDN17P56750 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLDN17P56750 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLDN17P56750 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLDN17P56750 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLDN17P56750 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms