Protein–RNA interactions for Protein: P55769

SNU13, NHP2-like protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNU13P55769 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNU13P55769 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNU13P55769 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SNU13P55769 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNU13P55769 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNU13P55769 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNU13P55769 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNU13P55769 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNU13P55769 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNU13P55769 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNU13P55769 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNU13P55769 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNU13P55769 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNU13P55769 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNU13P55769 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNU13P55769 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNU13P55769 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNU13P55769 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNU13P55769 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNU13P55769 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNU13P55769 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNU13P55769 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNU13P55769 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNU13P55769 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SNU13P55769 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNU13P55769 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SNU13P55769 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNU13P55769 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNU13P55769 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNU13P55769 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNU13P55769 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNU13P55769 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNU13P55769 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNU13P55769 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNU13P55769 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNU13P55769 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNU13P55769 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNU13P55769 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNU13P55769 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNU13P55769 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNU13P55769 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNU13P55769 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNU13P55769 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNU13P55769 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNU13P55769 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNU13P55769 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNU13P55769 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNU13P55769 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNU13P55769 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNU13P55769 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SNU13P55769 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SNU13P55769 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SNU13P55769 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SNU13P55769 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SNU13P55769 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SNU13P55769 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SNU13P55769 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SNU13P55769 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SNU13P55769 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SNU13P55769 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNU13P55769 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNU13P55769 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNU13P55769 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNU13P55769 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNU13P55769 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SNU13P55769 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SNU13P55769 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNU13P55769 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNU13P55769 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNU13P55769 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNU13P55769 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNU13P55769 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNU13P55769 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNU13P55769 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNU13P55769 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNU13P55769 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNU13P55769 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNU13P55769 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNU13P55769 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNU13P55769 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNU13P55769 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNU13P55769 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNU13P55769 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNU13P55769 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNU13P55769 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNU13P55769 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNU13P55769 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNU13P55769 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNU13P55769 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNU13P55769 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNU13P55769 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNU13P55769 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNU13P55769 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNU13P55769 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNU13P55769 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNU13P55769 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNU13P55769 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNU13P55769 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNU13P55769 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNU13P55769 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms