Protein–RNA interactions for Protein: P54852

EMP3, Epithelial membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMP3P54852 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EMP3P54852 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EMP3P54852 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EMP3P54852 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
EMP3P54852 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
EMP3P54852 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
EMP3P54852 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
EMP3P54852 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
EMP3P54852 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
EMP3P54852 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
EMP3P54852 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
EMP3P54852 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
EMP3P54852 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
EMP3P54852 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
EMP3P54852 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
EMP3P54852 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
EMP3P54852 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
EMP3P54852 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
EMP3P54852 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
EMP3P54852 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
EMP3P54852 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
EMP3P54852 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
EMP3P54852 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
EMP3P54852 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
EMP3P54852 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
EMP3P54852 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
EMP3P54852 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
EMP3P54852 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
EMP3P54852 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
EMP3P54852 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
EMP3P54852 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
EMP3P54852 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
EMP3P54852 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
EMP3P54852 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
EMP3P54852 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
EMP3P54852 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
EMP3P54852 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
EMP3P54852 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
EMP3P54852 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
EMP3P54852 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
EMP3P54852 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
EMP3P54852 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EMP3P54852 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EMP3P54852 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EMP3P54852 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EMP3P54852 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EMP3P54852 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EMP3P54852 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EMP3P54852 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EMP3P54852 SMIM26-201ENST00000411646 505 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EMP3P54852 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EMP3P54852 SMIM26-202ENST00000435844 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EMP3P54852 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
EMP3P54852 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EMP3P54852 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EMP3P54852 AC132872.1-201ENST00000566986 1195 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
EMP3P54852 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EMP3P54852 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EMP3P54852 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EMP3P54852 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EMP3P54852 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EMP3P54852 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EMP3P54852 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EMP3P54852 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EMP3P54852 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EMP3P54852 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EMP3P54852 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EMP3P54852 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EMP3P54852 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EMP3P54852 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EMP3P54852 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EMP3P54852 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EMP3P54852 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EMP3P54852 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EMP3P54852 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EMP3P54852 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EMP3P54852 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EMP3P54852 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EMP3P54852 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
EMP3P54852 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EMP3P54852 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EMP3P54852 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
EMP3P54852 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EMP3P54852 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EMP3P54852 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EMP3P54852 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EMP3P54852 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EMP3P54852 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EMP3P54852 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EMP3P54852 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EMP3P54852 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EMP3P54852 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EMP3P54852 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EMP3P54852 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EMP3P54852 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EMP3P54852 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EMP3P54852 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EMP3P54852 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EMP3P54852 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EMP3P54852 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms