Protein–RNA interactions for Protein: P52797

EFNA3, Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA3P52797 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFNA3P52797 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms