Protein–RNA interactions for Protein: P51398

DAP3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DAP3P51398 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DAP3P51398 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DAP3P51398 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DAP3P51398 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DAP3P51398 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DAP3P51398 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DAP3P51398 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DAP3P51398 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DAP3P51398 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DAP3P51398 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DAP3P51398 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DAP3P51398 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DAP3P51398 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
DAP3P51398 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DAP3P51398 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
DAP3P51398 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DAP3P51398 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DAP3P51398 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DAP3P51398 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DAP3P51398 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DAP3P51398 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DAP3P51398 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DAP3P51398 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DAP3P51398 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DAP3P51398 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DAP3P51398 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DAP3P51398 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DAP3P51398 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DAP3P51398 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DAP3P51398 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DAP3P51398 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DAP3P51398 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DAP3P51398 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DAP3P51398 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DAP3P51398 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DAP3P51398 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DAP3P51398 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DAP3P51398 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DAP3P51398 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DAP3P51398 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
DAP3P51398 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DAP3P51398 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DAP3P51398 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
DAP3P51398 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DAP3P51398 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DAP3P51398 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DAP3P51398 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DAP3P51398 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DAP3P51398 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DAP3P51398 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DAP3P51398 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DAP3P51398 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DAP3P51398 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DAP3P51398 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DAP3P51398 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DAP3P51398 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DAP3P51398 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DAP3P51398 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DAP3P51398 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DAP3P51398 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DAP3P51398 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DAP3P51398 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DAP3P51398 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DAP3P51398 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DAP3P51398 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DAP3P51398 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DAP3P51398 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DAP3P51398 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DAP3P51398 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DAP3P51398 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DAP3P51398 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DAP3P51398 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DAP3P51398 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DAP3P51398 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DAP3P51398 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
DAP3P51398 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DAP3P51398 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DAP3P51398 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
DAP3P51398 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DAP3P51398 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DAP3P51398 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DAP3P51398 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DAP3P51398 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DAP3P51398 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DAP3P51398 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DAP3P51398 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DAP3P51398 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DAP3P51398 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DAP3P51398 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DAP3P51398 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DAP3P51398 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DAP3P51398 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DAP3P51398 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DAP3P51398 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DAP3P51398 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DAP3P51398 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DAP3P51398 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DAP3P51398 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
DAP3P51398 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DAP3P51398 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms