Protein–RNA interactions for Protein: P49247

RPIA, Ribose-5-phosphate isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPIAP49247 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPIAP49247 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPIAP49247 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPIAP49247 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPIAP49247 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPIAP49247 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPIAP49247 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPIAP49247 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPIAP49247 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPIAP49247 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPIAP49247 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPIAP49247 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
RPIAP49247 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPIAP49247 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPIAP49247 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPIAP49247 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPIAP49247 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPIAP49247 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
RPIAP49247 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPIAP49247 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
RPIAP49247 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPIAP49247 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPIAP49247 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
RPIAP49247 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPIAP49247 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPIAP49247 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPIAP49247 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
RPIAP49247 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPIAP49247 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPIAP49247 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPIAP49247 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPIAP49247 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPIAP49247 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPIAP49247 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RPIAP49247 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RPIAP49247 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RPIAP49247 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RPIAP49247 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RPIAP49247 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RPIAP49247 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RPIAP49247 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RPIAP49247 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RPIAP49247 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RPIAP49247 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RPIAP49247 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RPIAP49247 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RPIAP49247 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RPIAP49247 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RPIAP49247 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RPIAP49247 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RPIAP49247 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RPIAP49247 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RPIAP49247 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
RPIAP49247 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RPIAP49247 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RPIAP49247 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RPIAP49247 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RPIAP49247 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RPIAP49247 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RPIAP49247 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RPIAP49247 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RPIAP49247 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RPIAP49247 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RPIAP49247 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RPIAP49247 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RPIAP49247 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RPIAP49247 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RPIAP49247 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RPIAP49247 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
RPIAP49247 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RPIAP49247 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RPIAP49247 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RPIAP49247 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RPIAP49247 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RPIAP49247 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
RPIAP49247 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RPIAP49247 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RPIAP49247 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RPIAP49247 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RPIAP49247 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RPIAP49247 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RPIAP49247 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RPIAP49247 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RPIAP49247 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
RPIAP49247 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RPIAP49247 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RPIAP49247 NIFKP4-201ENST00000567275 1192 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
RPIAP49247 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RPIAP49247 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RPIAP49247 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RPIAP49247 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RPIAP49247 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
RPIAP49247 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RPIAP49247 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RPIAP49247 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RPIAP49247 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RPIAP49247 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RPIAP49247 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RPIAP49247 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RPIAP49247 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms