Protein–RNA interactions for Protein: P48739

PITPNB, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNBP48739 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms