Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
RANGAP1P46060 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
RANGAP1P46060 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RANGAP1P46060 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RANGAP1P46060 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
RANGAP1P46060 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RANGAP1P46060 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RANGAP1P46060 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
RANGAP1P46060 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RANGAP1P46060 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RANGAP1P46060 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RANGAP1P46060 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RANGAP1P46060 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RANGAP1P46060 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
RANGAP1P46060 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RANGAP1P46060 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RANGAP1P46060 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RANGAP1P46060 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RANGAP1P46060 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RANGAP1P46060 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RANGAP1P46060 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RANGAP1P46060 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RANGAP1P46060 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RANGAP1P46060 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RANGAP1P46060 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RANGAP1P46060 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RANGAP1P46060 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
RANGAP1P46060 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RANGAP1P46060 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
RANGAP1P46060 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
RANGAP1P46060 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
RANGAP1P46060 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RANGAP1P46060 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RANGAP1P46060 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RANGAP1P46060 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RANGAP1P46060 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RANGAP1P46060 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RANGAP1P46060 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RANGAP1P46060 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RANGAP1P46060 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RANGAP1P46060 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RANGAP1P46060 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RANGAP1P46060 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RANGAP1P46060 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RANGAP1P46060 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RANGAP1P46060 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RANGAP1P46060 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RANGAP1P46060 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RANGAP1P46060 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
RANGAP1P46060 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RANGAP1P46060 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RANGAP1P46060 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RANGAP1P46060 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RANGAP1P46060 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RANGAP1P46060 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RANGAP1P46060 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RANGAP1P46060 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RANGAP1P46060 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RANGAP1P46060 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
RANGAP1P46060 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RANGAP1P46060 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RANGAP1P46060 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RANGAP1P46060 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RANGAP1P46060 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RANGAP1P46060 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RANGAP1P46060 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RANGAP1P46060 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RANGAP1P46060 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RANGAP1P46060 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RANGAP1P46060 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RANGAP1P46060 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RANGAP1P46060 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RANGAP1P46060 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RANGAP1P46060 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RANGAP1P46060 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
RANGAP1P46060 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RANGAP1P46060 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RANGAP1P46060 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RANGAP1P46060 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
RANGAP1P46060 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RANGAP1P46060 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RANGAP1P46060 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RANGAP1P46060 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RANGAP1P46060 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RANGAP1P46060 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RANGAP1P46060 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RANGAP1P46060 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RANGAP1P46060 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RANGAP1P46060 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RANGAP1P46060 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RANGAP1P46060 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RANGAP1P46060 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RANGAP1P46060 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
RANGAP1P46060 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RANGAP1P46060 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RANGAP1P46060 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RANGAP1P46060 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RANGAP1P46060 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RANGAP1P46060 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RANGAP1P46060 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms