Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APOBEC1P41238 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms