Protein–RNA interactions for Protein: P38571

LIPA, Lysosomal acid lipase/cholesteryl ester hydrolase, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIPAP38571 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LIPAP38571 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LIPAP38571 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LIPAP38571 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LIPAP38571 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LIPAP38571 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LIPAP38571 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LIPAP38571 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LIPAP38571 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LIPAP38571 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LIPAP38571 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LIPAP38571 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LIPAP38571 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LIPAP38571 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LIPAP38571 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LIPAP38571 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LIPAP38571 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LIPAP38571 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LIPAP38571 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LIPAP38571 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LIPAP38571 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LIPAP38571 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LIPAP38571 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LIPAP38571 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LIPAP38571 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
LIPAP38571 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LIPAP38571 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LIPAP38571 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LIPAP38571 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LIPAP38571 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LIPAP38571 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LIPAP38571 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LIPAP38571 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
LIPAP38571 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LIPAP38571 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LIPAP38571 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LIPAP38571 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LIPAP38571 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LIPAP38571 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LIPAP38571 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LIPAP38571 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LIPAP38571 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
LIPAP38571 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LIPAP38571 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LIPAP38571 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LIPAP38571 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LIPAP38571 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LIPAP38571 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LIPAP38571 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LIPAP38571 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LIPAP38571 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LIPAP38571 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LIPAP38571 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LIPAP38571 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LIPAP38571 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LIPAP38571 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LIPAP38571 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LIPAP38571 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LIPAP38571 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LIPAP38571 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LIPAP38571 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LIPAP38571 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LIPAP38571 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LIPAP38571 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LIPAP38571 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LIPAP38571 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LIPAP38571 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LIPAP38571 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LIPAP38571 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LIPAP38571 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LIPAP38571 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LIPAP38571 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LIPAP38571 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LIPAP38571 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LIPAP38571 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LIPAP38571 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LIPAP38571 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LIPAP38571 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LIPAP38571 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LIPAP38571 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LIPAP38571 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LIPAP38571 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LIPAP38571 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LIPAP38571 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LIPAP38571 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LIPAP38571 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LIPAP38571 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LIPAP38571 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LIPAP38571 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LIPAP38571 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LIPAP38571 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LIPAP38571 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LIPAP38571 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LIPAP38571 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LIPAP38571 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LIPAP38571 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LIPAP38571 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LIPAP38571 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
LIPAP38571 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LIPAP38571 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms