Protein–RNA interactions for Protein: P38117

ETFB, Electron transfer flavoprotein subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETFBP38117 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ETFBP38117 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ETFBP38117 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ETFBP38117 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ETFBP38117 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ETFBP38117 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ETFBP38117 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ETFBP38117 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ETFBP38117 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ETFBP38117 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ETFBP38117 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ETFBP38117 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ETFBP38117 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ETFBP38117 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ETFBP38117 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ETFBP38117 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ETFBP38117 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ETFBP38117 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ETFBP38117 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ETFBP38117 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ETFBP38117 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ETFBP38117 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ETFBP38117 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ETFBP38117 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ETFBP38117 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ETFBP38117 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ETFBP38117 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ETFBP38117 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ETFBP38117 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ETFBP38117 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ETFBP38117 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ETFBP38117 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ETFBP38117 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ETFBP38117 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ETFBP38117 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ETFBP38117 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ETFBP38117 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ETFBP38117 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ETFBP38117 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ETFBP38117 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ETFBP38117 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ETFBP38117 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ETFBP38117 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ETFBP38117 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ETFBP38117 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ETFBP38117 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ETFBP38117 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ETFBP38117 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ETFBP38117 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ETFBP38117 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ETFBP38117 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ETFBP38117 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ETFBP38117 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ETFBP38117 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ETFBP38117 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ETFBP38117 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ETFBP38117 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ETFBP38117 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ETFBP38117 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ETFBP38117 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ETFBP38117 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ETFBP38117 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ETFBP38117 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ETFBP38117 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ETFBP38117 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ETFBP38117 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ETFBP38117 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ETFBP38117 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ETFBP38117 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ETFBP38117 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ETFBP38117 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ETFBP38117 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ETFBP38117 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ETFBP38117 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ETFBP38117 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ETFBP38117 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ETFBP38117 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ETFBP38117 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ETFBP38117 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ETFBP38117 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ETFBP38117 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ETFBP38117 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ETFBP38117 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ETFBP38117 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ETFBP38117 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ETFBP38117 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ETFBP38117 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ETFBP38117 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ETFBP38117 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ETFBP38117 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ETFBP38117 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ETFBP38117 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ETFBP38117 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ETFBP38117 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ETFBP38117 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ETFBP38117 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ETFBP38117 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ETFBP38117 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ETFBP38117 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ETFBP38117 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms