Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms