Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CHRNA7P36544 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms