Protein–RNA interactions for Protein: P35968

KDR, Vascular endothelial growth factor receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDRP35968 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KDRP35968 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KDRP35968 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
KDRP35968 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KDRP35968 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KDRP35968 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
KDRP35968 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
KDRP35968 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KDRP35968 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KDRP35968 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KDRP35968 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KDRP35968 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KDRP35968 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KDRP35968 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KDRP35968 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KDRP35968 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KDRP35968 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KDRP35968 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KDRP35968 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KDRP35968 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KDRP35968 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KDRP35968 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KDRP35968 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KDRP35968 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KDRP35968 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KDRP35968 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KDRP35968 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KDRP35968 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KDRP35968 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KDRP35968 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KDRP35968 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
KDRP35968 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KDRP35968 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KDRP35968 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KDRP35968 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KDRP35968 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KDRP35968 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KDRP35968 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KDRP35968 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KDRP35968 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KDRP35968 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KDRP35968 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KDRP35968 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KDRP35968 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KDRP35968 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KDRP35968 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KDRP35968 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KDRP35968 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KDRP35968 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KDRP35968 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KDRP35968 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KDRP35968 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KDRP35968 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KDRP35968 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
KDRP35968 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KDRP35968 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
KDRP35968 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KDRP35968 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KDRP35968 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KDRP35968 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
KDRP35968 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KDRP35968 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KDRP35968 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KDRP35968 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KDRP35968 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KDRP35968 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KDRP35968 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KDRP35968 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KDRP35968 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KDRP35968 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KDRP35968 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
KDRP35968 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KDRP35968 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KDRP35968 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KDRP35968 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
KDRP35968 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KDRP35968 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KDRP35968 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KDRP35968 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KDRP35968 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KDRP35968 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KDRP35968 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KDRP35968 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KDRP35968 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KDRP35968 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KDRP35968 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KDRP35968 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KDRP35968 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KDRP35968 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KDRP35968 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KDRP35968 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KDRP35968 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KDRP35968 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KDRP35968 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KDRP35968 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KDRP35968 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
KDRP35968 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
KDRP35968 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KDRP35968 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KDRP35968 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms