Protein–RNA interactions for Protein: P33527

ABCC1, Multidrug resistance-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC1P33527 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ABCC1P33527 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ABCC1P33527 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ABCC1P33527 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
ABCC1P33527 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
ABCC1P33527 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ABCC1P33527 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ABCC1P33527 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
ABCC1P33527 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
ABCC1P33527 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ABCC1P33527 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ABCC1P33527 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ABCC1P33527 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ABCC1P33527 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ABCC1P33527 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ABCC1P33527 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ABCC1P33527 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ABCC1P33527 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ABCC1P33527 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
ABCC1P33527 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ABCC1P33527 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ABCC1P33527 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ABCC1P33527 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ABCC1P33527 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ABCC1P33527 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
ABCC1P33527 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ABCC1P33527 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ABCC1P33527 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ABCC1P33527 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ABCC1P33527 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ABCC1P33527 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ABCC1P33527 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ABCC1P33527 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ABCC1P33527 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ABCC1P33527 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ABCC1P33527 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ABCC1P33527 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ABCC1P33527 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ABCC1P33527 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ABCC1P33527 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ABCC1P33527 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ABCC1P33527 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ABCC1P33527 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ABCC1P33527 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ABCC1P33527 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ABCC1P33527 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ABCC1P33527 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ABCC1P33527 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ABCC1P33527 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ABCC1P33527 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ABCC1P33527 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ABCC1P33527 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ABCC1P33527 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ABCC1P33527 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ABCC1P33527 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ABCC1P33527 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
ABCC1P33527 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ABCC1P33527 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ABCC1P33527 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ABCC1P33527 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ABCC1P33527 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ABCC1P33527 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ABCC1P33527 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ABCC1P33527 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ABCC1P33527 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ABCC1P33527 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ABCC1P33527 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ABCC1P33527 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ABCC1P33527 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ABCC1P33527 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ABCC1P33527 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
ABCC1P33527 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
ABCC1P33527 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ABCC1P33527 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
ABCC1P33527 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ABCC1P33527 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ABCC1P33527 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ABCC1P33527 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ABCC1P33527 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ABCC1P33527 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ABCC1P33527 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ABCC1P33527 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ABCC1P33527 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ABCC1P33527 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ABCC1P33527 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ABCC1P33527 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ABCC1P33527 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ABCC1P33527 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
ABCC1P33527 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
ABCC1P33527 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
ABCC1P33527 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ABCC1P33527 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ABCC1P33527 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ABCC1P33527 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ABCC1P33527 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ABCC1P33527 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ABCC1P33527 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ABCC1P33527 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ABCC1P33527 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ABCC1P33527 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms