Protein–RNA interactions for Protein: P32238

CCKAR, Cholecystokinin receptor type A, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKARP32238 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCKARP32238 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCKARP32238 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCKARP32238 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCKARP32238 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCKARP32238 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCKARP32238 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCKARP32238 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCKARP32238 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCKARP32238 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCKARP32238 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCKARP32238 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCKARP32238 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCKARP32238 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCKARP32238 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCKARP32238 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCKARP32238 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCKARP32238 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCKARP32238 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCKARP32238 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCKARP32238 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCKARP32238 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCKARP32238 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCKARP32238 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCKARP32238 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCKARP32238 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCKARP32238 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCKARP32238 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCKARP32238 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCKARP32238 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CCKARP32238 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCKARP32238 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCKARP32238 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CCKARP32238 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CCKARP32238 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CCKARP32238 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCKARP32238 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCKARP32238 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCKARP32238 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCKARP32238 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCKARP32238 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCKARP32238 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCKARP32238 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCKARP32238 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCKARP32238 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCKARP32238 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCKARP32238 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCKARP32238 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCKARP32238 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCKARP32238 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCKARP32238 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CCKARP32238 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCKARP32238 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCKARP32238 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCKARP32238 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCKARP32238 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCKARP32238 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCKARP32238 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCKARP32238 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCKARP32238 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCKARP32238 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCKARP32238 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCKARP32238 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCKARP32238 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCKARP32238 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCKARP32238 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCKARP32238 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCKARP32238 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCKARP32238 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCKARP32238 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCKARP32238 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCKARP32238 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CCKARP32238 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCKARP32238 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCKARP32238 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCKARP32238 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCKARP32238 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CCKARP32238 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CCKARP32238 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCKARP32238 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCKARP32238 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCKARP32238 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCKARP32238 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCKARP32238 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CCKARP32238 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCKARP32238 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCKARP32238 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCKARP32238 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCKARP32238 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCKARP32238 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCKARP32238 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCKARP32238 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCKARP32238 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CCKARP32238 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCKARP32238 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CCKARP32238 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCKARP32238 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCKARP32238 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCKARP32238 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CCKARP32238 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms