Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
HOXA13P31271 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXA13P31271 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXA13P31271 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXA13P31271 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXA13P31271 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXA13P31271 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXA13P31271 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXA13P31271 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXA13P31271 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXA13P31271 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXA13P31271 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXA13P31271 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXA13P31271 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXA13P31271 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXA13P31271 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXA13P31271 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXA13P31271 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXA13P31271 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXA13P31271 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXA13P31271 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXA13P31271 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXA13P31271 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXA13P31271 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXA13P31271 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXA13P31271 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXA13P31271 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXA13P31271 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXA13P31271 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXA13P31271 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXA13P31271 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXA13P31271 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXA13P31271 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXA13P31271 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXA13P31271 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXA13P31271 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXA13P31271 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXA13P31271 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXA13P31271 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXA13P31271 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXA13P31271 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXA13P31271 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXA13P31271 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXA13P31271 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXA13P31271 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXA13P31271 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXA13P31271 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXA13P31271 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXA13P31271 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXA13P31271 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXA13P31271 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXA13P31271 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXA13P31271 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXA13P31271 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXA13P31271 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXA13P31271 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXA13P31271 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXA13P31271 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXA13P31271 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXA13P31271 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXA13P31271 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXA13P31271 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXA13P31271 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXA13P31271 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXA13P31271 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXA13P31271 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXA13P31271 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXA13P31271 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXA13P31271 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXA13P31271 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXA13P31271 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXA13P31271 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXA13P31271 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXA13P31271 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXA13P31271 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXA13P31271 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXA13P31271 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXA13P31271 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXA13P31271 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXA13P31271 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXA13P31271 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXA13P31271 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXA13P31271 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXA13P31271 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXA13P31271 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXA13P31271 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXA13P31271 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXA13P31271 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXA13P31271 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXA13P31271 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXA13P31271 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXA13P31271 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXA13P31271 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXA13P31271 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXA13P31271 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXA13P31271 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXA13P31271 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms