Protein–RNA interactions for Protein: P31249

HOXD3, Homeobox protein Hox-D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD3P31249 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXD3P31249 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXD3P31249 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXD3P31249 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXD3P31249 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXD3P31249 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXD3P31249 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXD3P31249 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXD3P31249 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXD3P31249 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXD3P31249 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXD3P31249 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXD3P31249 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXD3P31249 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXD3P31249 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXD3P31249 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXD3P31249 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXD3P31249 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXD3P31249 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXD3P31249 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXD3P31249 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXD3P31249 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXD3P31249 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXD3P31249 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXD3P31249 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXD3P31249 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXD3P31249 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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HOXD3P31249 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXD3P31249 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXD3P31249 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXD3P31249 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXD3P31249 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXD3P31249 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXD3P31249 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXD3P31249 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXD3P31249 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXD3P31249 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXD3P31249 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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HOXD3P31249 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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HOXD3P31249 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXD3P31249 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXD3P31249 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
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HOXD3P31249 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HOXD3P31249 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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HOXD3P31249 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXD3P31249 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXD3P31249 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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HOXD3P31249 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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HOXD3P31249 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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HOXD3P31249 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXD3P31249 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXD3P31249 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXD3P31249 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXD3P31249 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXD3P31249 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXD3P31249 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXD3P31249 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXD3P31249 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXD3P31249 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXD3P31249 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXD3P31249 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXD3P31249 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXD3P31249 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXD3P31249 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXD3P31249 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXD3P31249 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXD3P31249 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXD3P31249 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXD3P31249 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXD3P31249 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXD3P31249 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HOXD3P31249 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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